境外电商在台湾进行B2C交易，包括服务使用费、影视受听权以及手续费等收入，都视为我国境内销售额，须课营业税及营所税。不过台北国税局指出，境外电商若是註册于租税协定国，可适用营业利润免税规定，包括Amazon、Agoda、Uber、Netflix等知名电商，其实在台营收都可免营所税。

境外电商课税制度从2017年上路，特别针对B2C交易模式加强课徵营所税、营业税，许多境外电商都从今年导入云端发票，让国税局可以顺利课徵5%营业税。

不过当碰上租税协定时，仍要回归单边课税的原则，官员指出，如果境外电商所在的国家有和我国签署全面性所得税协定，在台湾也没有负责销售的常设机构，那么台湾来源收入就可以申请适用营业利润减免规定，也就是免去在台缴纳营所税的义务，只要在註册国缴纳所得税即可。

台湾目前共有33个租税协定国，其中欧洲就占了16个。