同一公司在同一年度內的所得稅，卻有可能因為查核時點及項目不同，而有數個行政處分，實屬正常。財政部北區國稅局表示，每次補稅行政處分都是各自存在，是就差額部分補徵，並非取代前次處分，納稅人千萬別誤以為只要繳納最後一次處分即可，以免影響自身權益。

北區國稅局舉例，曾有一家公司的2017年所得稅申報案件，經國稅局查核通知提示帳簿文據，結果公司未提供，於是國稅局以其自行申報營業收入按同業利潤標準淨利率計算，核定補稅290萬元，是此案第一次核定補稅。

隨後國稅局又發現這間公司有漏報銷貨收入，因此又再核定補稅282萬元，是第二次核定補稅。