財政部國際財政司指出，租稅協定不只使跨國台商享租稅優惠，台商在協定國做生意，還可享三大保障，包括國際稅務爭議援助、移轉訂價相對應調整，以及預先訂價協議，當台商在外國被追稅，國內可以提供部分合理補償。目前台灣已和33個國家簽訂所得稅協定，包括歐美國家、日本以及新南向國家，讓跨國台商可以享有優惠扣繳率，更可免去雙重課稅的風險。官員表示，其中更有一項很重要的機制，稱為相互協議程序（Mutual Agreement Procedure, MAP），當台商在協定國受到委屈，可以找財政部出面溝通解決。
舉例而言，如果協定國行政程序較冗長，甚至刁難台商在申請所得稅協定優惠的權利，官員指出，這種情況就能提出申請，雙方主管機關將協商解決爭議，確保所得稅協定能落實海外台商的權益。
第二種情況也很重要，當協定國的稅務機關，認定台商不當移轉訂價，而調高台商在當地的課稅義務時，台商也可以回來台灣求助，如果國稅局認為對方調幅合理，還可以單方面進行相對應調整，讓台商在台灣可以少繳一點稅，這方面就有多件荷蘭台商曾受惠。
官員指出，移轉訂價查核的原則，是審視跨國企業各國事業體的收入分配合理性，整個集團在全球的收入是確定的資訊，如果集團被他國調增收入並課稅，代表在台收入可能低於原本規劃的移轉訂價架構，因此可以調減在台的納稅義務。
官員指出，近十年來共發生34件相互協議申請案件，目前辦結20件，其中有十件就是移轉訂價相對應調整，台商在外國被加稅，台灣方面就可以依據協議，享相對應減稅。
第三項措施則是雙邊預先訂價協議，官員指出，這其實是用預先申請的方式，解決未來因跨國移轉訂價被調稅的風險，目前已有不少日商在台子公司已經提出申請，財政部正在與日本主管機關交涉當中。
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